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迪威国际华大智造基因测序仪助力我国发现首例境外变异新冠毒株
【信息时间: 2021-01-10 13:43:05   阅读次数: 】【字号

 深圳特区报讯(记者 闻坤 实习生 陈婉莹 李秀青)近日,中国疾控中心周刊(China CDC Weekly)刊文称,我国海关实验室日前监测到一名从境外返回的23岁女性新冠感染者,检测发现,该病例感染了新变异的新冠病毒毒株。据悉,此次助力发现我国首例境外变异新冠病毒毒株的测序平台是华大智造自主研发的一款高通量测序仪。

据了解,中国疾控在检测到第一株VOC毒株后就已上报,并在中国疾控官方杂志China CDC Weekly(中国疾控周报)中向全球发布。疾控中心对该患者的核酸样本以多重PCR方案建库,并使用华大智造高通量测序平台MGISEQ-200对病毒核酸文库进行深度测序。

研究人员通过对测序数据进行生物信息分析,发现该毒株与2020年11月份监测到的毒株不同,显示32个核苷酸变异位点,通过进一步对比发现,该患者感染的毒株基因序列中包含了10月下旬开始在境外流行的VUI202012/01新病毒株中所有的28个变异点位,其中包括刺突蛋白中的3个氨基酸缺失和7个氨基酸突变。基于测序数据和流行病学调查结果,国家疾控将此境外输入性病例定义为中国监测到的首例英国变异VUI202012/01病毒株,并加强了对患者密切接触的调查和对相关场所的消杀。

据介绍,华大智造MGISEQ-200是一款小巧灵活且性能强劲的高通量测序仪,它可以适配病原检测、组装以及溯源等应用,满足对疾病精准防控的需求。此外,该测序平台现已推出全新配置,支持更多极端文库测序,大幅提升测序速度。目前,该测序仪已入驻全球多个国家海关实验室、疾病预防控制中心,为疫情一线提供了关键性支持。

 


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